Die SutterPatch® Software ist eine mit allen Funktionen ausgestattete Anwendung zur Erfassung, Verwaltung und Analyse elektrophysiologischer Daten für Windows- oder Mac OS-Computer. SutterPatch wird mit allen Sutter Instrumenten-Patch-Klemmverstärkersystemen gebündelt geliefert. Die Software steuert die Datenerfassung, bietet Echtzeit-Messungen zur Unterstützung der Entscheidungsfindung während des Experiments, verfolgt alle Verstärkerparameter, zeichnet den experimentellen Verlauf auf und speichert einen Satz von bis zu 600 Metadaten-Parametern. SutterPatch wurde in der neuesten Version von Igor Pro von WaveMetrics, Inc. entwickelt und bietet sofortigen Zugang zu Igors leistungsstarken wissenschaftlichen und technischen Analysewerkzeugen.

Version 2 der SutterPatch Software bietet Unterstützung für die neuen dPatch®-Digitalverstärkersysteme sowie eine Vielzahl neuer Funktionen und Verbesserungen der Benutzeroberfläche, die auch für die IPA® Familie der Verstärkersysteme gelten. Der Membrantest und Free Run wurden aktualisiert. Neue Dreifach-Schieberegler und 2D-Matrix-Steuerungen erleichtern die Kompensationseinstellungen im Amplifier Control Panel.

Besonderer Wert wurde auf eine intuitive Navigation durch große Datensätze gelegt. Bedienelemente, die aus Elektrophysiologie-Software oder Anwendungen in anderen Bereichen bekannt sind, sowie völlig neue Ansätze machen das Auffinden eines bestimmten Abschnitts eines Experiments sehr einfach.

Die strukturierte Architektur der Datendateien wurde so konzipiert, dass der Kontext jeder Probe innerhalb eines Experiments erhalten bleibt. Mit geringem Aufwand werden zu Beginn eines Experiments eine Fülle von Metadaten-Parametern erfasst - möglichst automatisch, auf Wunsch vom Benutzer konfiguriert. Jeder Parameter kann überprüft werden, bevor ein Paradigma oder eine Routine ausgeführt wird.

Die SutterPatch Software wird mit einer Sammlung von Beispielparadigmen und -routinen geliefert, die die Konfiguration von häufig ausgeführten experimentellen Szenarien erleichtern.

SutterPatch bietet Echtzeitanalysefähigkeiten, die automatisch Diagramme wie I-V-Kurven oder ein Zeitverlaufsdiagramm erstellen, während das Experiment läuft. Es können bis zu 8 Analysegrafiken angezeigt werden, die jeweils aus 16 möglichen Messungen aus den Eingangssignalen abgeleitet werden. Zu den Analysen gehören Mittelwert, Steigung, Anstiegszeit, Häufigkeit der Schwellwertüberschreitung usw. Dies erleichtert die Entscheidungsfindung über den weiteren Verlauf eines Experiments.

Neben der Echtzeitanalyse unterstützt SutterPatch auch die Weiterverarbeitung nach dem Experiment für anspruchsvollste Analyseverfahren. SutterPatch fügt anwendungsspezifische Fähigkeiten zusätzlich zu den umfangreichen Analysefunktionen hinzu, die in Igor Pro enthalten sind. Gleichungen und Variablen erleichtern die Verwendung komplexerer Algorithmen sowohl in Routinen als auch in Paradigmen.

Merkmale

• Unterstützung für alle Sutter Instrumentenverstärkersysteme, einschließlich der neuen dPatch®-Digitalverstärkersysteme
• Dynamic Clamping mit dem digitalen dPATCH® Patch-Clamp-Verstärker
• Das Oszilloskop-Fenster bietet eine intuitive, effiziente Navigation durch Ihre Daten
  • Schaltflächen und Schieberegler zur Zoomsteuerung
  • Zum Vergrößern entlang der Achse ziehen
  • Mausrad-Zoom
  • Marquee-Zoom
  • Bildlaufleisten
  • Kontinuierliche und Momentaufnahme-Autoskalierung
  • Sweep, Zeitverlauf und verkettete Anzeige
  • Neuartige 3D-Darstellung
  • Einzigartiger Übersichtsnavigator zur panoramaartigen Untersuchung und bequemen Bewegung innerhalb eines Datenabschnitts
Das Paradigm Review-Fenster bietet schnellen Zugriff auf individuelle Routinedaten
• Membrantest verfolgt die Zellgesundheit und andere Qualitätskontrollparameter
• Zu den Wellenform-Typen gehören Doppelimpulse, Sinus- und Dreieckzüge und momentane RMS-Rauschmessung
• Gleichzeitige Anzeige von bis zu zwei Verstärker- oder Hilfseingangssignalen und einer Befehlswellenform
• Testpulsparameter vollständig konfigurierbar
• Puls-Mittelwertbildung
• Audio-Monitor
Routinen steuern die Datenerfassung mit oder ohne Anwendung von Befehlswellenformen
• Muster-Routinen-Pool mit vorkonfigurierten Paradigmen für viele gängige Anwendungen
• Festverdrahtete Signale von Sutter Instrumenten-Hardware und Hilfseingangssignale werden aufgezeichnet
• Das an die Zelle angelegte Befehlssignal wird überwacht und aufgezeichnet.
• Analoge und digitale Ausgangssignale steuern Peripherie- und Drittanbieterinformationen
• Bis zu 50 Segmente pro Sweep für größtmögliche Flexibilität bei der Gestaltung komplexester Befehlswellenformen
• Vorkonfigurierte Segmentformen wie Sinus, Rechteck und Chirp für einfaches Wellenformdesign
• Wellenformvorlage ermöglicht die "Wiedergabe" eines aufgezeichneten Signals in eine Zelle oder die Anwendung eines mathematischen Ausdrucks als Wellenform
• Messungen liefern die Grundlage für die Echtzeitanalyse und ermöglichen die Entscheidungsfindung im Verlauf des Experiments
• Paradigmen ermöglichen Prozessautomatisierung und eliminieren die Verzerrung der Bediener
• Muster-Paradigmen-Pool mit vorkonfigurierten Paradigmen für viele gängige Anwendungen
• Konfigurieren Sie den Verstärker auf reproduzierbare Standardeinstellungen
• Die Erfassung von Routine-Sequenzen ermöglicht vorgeplante Experimente und minimiert die Verzerrung des Bedieners
• Ablaufsteuerung für interaktive oder automatisierte Entscheidungsfindung während des Experiments
• Verkettung von Paradigmen bietet zusätzliche Flexibilität
• Automatische Erstellung von Layouts für standardisierte Dokumentation
• Mit dem Lösungseditor können Sie Lösungen und Verbindungen verfolgen, und er unterstützt die direkte Steuerung eines Lösungswechslers.
• Anfangsbedingungen und alle Lösungsänderungen werden automatisch in die MetaData geschrieben
• Analoge oder digitale Ausgänge steuern alle gängigen Lösungsschalter
• Der Datennavigator zeigt das gesamte Experiment in einer Baumstruktur
• Vorschau des ersten erfassten Signals
• Schneller Zugang zu Paradigmenüberprüfung, Reanalyse-Umfang, Metadaten und Routine-Informationen
• Echtzeit- und Offline-Analysen, einschließlich Erkennung von Mini-/Synapsen-Ereignissen und Charakterisierung des Aktionspotenzials
• Messungen, die als Teil von Routinen konfiguriert sind, erzeugen Echtzeit-Grafiken
• Virtuelle Signale liefern dem Benutzer Informationen, die aus physikalischen Eingangssignalen, mathematischen Gleichungen, Signalmodifikationen oder beliebigen Kombinationen davon abgeleitet werden. Hoch- und Tiefpassfilter, Lock-In-Verstärker und die Subtraktion eines Referenz-Sweeps sind neu in Version 2
• Paradigmen können für weitere Echtzeit-Analysen auf Messungen zugreifen
• Gleichungen und Variablen bieten größtmögliche Flexibilität
• Ereigniserkennung unter Verwendung eines leistungsfähigen, auf Entfaltung basierenden Algorithmus
• Einfaches Exportieren von Daten in Microsoft Excel und andere Tabellenkalkulationsprogramme zur Kompatibilität mit bestehenden Analyseverfahren
• Eine Fülle von Merkmalen der nativen Igor-Pro-Analyse
• Unterstützung für IPA-Mehrfachverstärkermodus
• Eine Kombination von zwei beliebigen IPA®- oder Doppel-IPA®-Verstärkern kann angeschlossen werden
• Bis zu 16 Eingangskanäle werden unterstützt

SYSTEMVORAUSSETZUNGEN

für die Systeme der IPA-Familie

Minimale Konfiguration:

• Windows 10 (64-Bit) oder MacOS: 10.11, El Capitan oder höher
• Prozessor: Zwei-Kernel i5
• Arbeitsspeicher: 3 GB
• Festplatte: 500 GB oder mehr
• Bildschirm-Auflösung: 1024 × 768 (XGA)
• 1 verfügbarer USB 2.0-Hochgeschwindigkeitsanschluss

Empfohlene Konfiguration:

• Windows 10 (64-Bit) oder MacOS: 10.11, El Capitan oder höher
• Prozessor: Zwei-Kernel i5
• Arbeitsspeicher: 3 GB
• Solid-State-Laufwerk (SSD): 500 GB oder mehr
• Bildschirmauflösung 1920 × 1080 (Full HD)
• 1 verfügbarer USB 2.0-Hochgeschwindigkeitsanschluss

für dPatch-Systeme

Minimale Konfiguration:

• Windows 10 (64-Bit) oder MacOS: 10.11, El Capitan oder höher
• Prozessor: Zwei-Kernel i5
• Arbeitsspeicher: 6 GB
• Solid-State-Laufwerk (SSD): 500 GB oder größer
• Bildschirm-Auflösung: 1024 × 768 (XGA)
• 1 verfügbarer USB 3.0-Hochgeschwindigkeitsanschluss (auf der Hauptplatine, keine PCIx-Karte o.ä.)

Empfohlene Konfiguration:

• Windows 10 (64-Bit) oder MacOS: 10.11, El Capitan oder höher
• Prozessor: Zwei-Kernel i5
• Arbeitsspeicher: 16 GB
• Solid-State-Laufwerk (SSD): 500 GB oder größer
• Bildschirmauflösung 1920 × 1080 (Full HD)
• 1 verfügbarer USB 3.0-Hochgeschwindigkeitsanschluss (auf der Hauptplatine, keine PCIx-Karte o.ä.)

SUTTERPATCH® Datenerfassungs-Managementsystem und Analyse-Software: Im Lieferumfang aller Sutter Instrumentenverstärkersysteme enthalten

Anmerkungen:

Die USB 3.0-Anschlüsse sind zu USB 2.0 kompatibel.
Langsamere USB 2.0-"Full-Speed"-Ports, die manchmal auf älteren Windows-PCs oder USB-Add-in-Karten zu finden sind, werden indes nicht unterstützt.

Um auf einem PC-Computer unter Windows nach High Speed USB 2.0 oder USB 3.0 zu suchen, suchen Sie im Abschnitt Systemsteuerung > Geräte-Manager > Universal Serial Bus-Controller nach "erweiterten" Host-Controllern. Da dies keine Zuordnungsinformationen zu den physischen Anschlüssen des Computers liefert und es eine Mischung von USB-Anschlussversionen geben kann, sollten Sie einzelne USB-Anschlüsse auf USB 2.0/3.0 High Speed-Betriebsleistung überprüfen. Als visueller Indikator sind USB 3.0-Ports oft blau eingefärbt.

USB-Hubs werden nicht unterstützt. USB-Zusatzkarten, auch wenn sie formal die High Speed- oder Super Speed-Spezifikationen erfüllen, werden nicht empfohlen. Sie sind oft architektonisch als USB-Hubs konfiguriert und können zu intermittierenden Übertragungsfehlern führen, die schwer zu beheben sind.

Betriebssysteme, die innerhalb von Virtualisierungssoftware-Plattformen wie VMware und Parallels installiert sind, werden ebenfalls nicht unterstützt.

Informationen zu Umgebungsparametern und eine detailliertere Spezifikation der Probeneigenschaften können mit den Rohdaten aufgezeichnet und gespeichert werden. Insgesamt werden über 600 Metadatenattribute unterstützt. Beispiele hierfür sind: Tierart, Genotyp, Datum/Uhrzeit, wann eine Zellprobe vorbereitet wurde, Aufzeichnungslösungen, Pipettenwiderstand, Hardware-Eigenschaften und detaillierte Informationen über angewandte Stimuli.

SutterPatch® Software

Das Dendrite- und SutterPatch-Softwaresystem wurde so entwickelt, dass der Benutzer Informationen über Geräteeinstellungen, Stimulusanwendung und externe Experimentparameter hinzufügen und diese zeitlich mit den Rohdatenspuren verknüpfen kann. Dazu gehören alle Erfassungseinstellungen sowie die zeitliche Planung und der Fortschritt des Experiments. Darüber hinaus kann der Experimentator manuell Tags auslösen, um Ereignisse wie die Reizanwendung in Instrumenten zu dokumentieren, die nicht mit dem Dendriten-System verbunden sind.

Informationen über Umgebungsparameter und eine detailliertere Spezifikation der Probeneigenschaften können mit den Rohdaten aufgezeichnet und gespeichert werden. Insgesamt werden über 600 Metadatenattribute unterstützt. Beispiele sind: Tierart, Genotyp, Datum/Uhrzeit, wann eine Zellprobe präpariert wurde, Aufzeichnungslösungen, Pipettenwiderstand, Hardware-Eigenschaften und detaillierte Informationen über angewandte Stimuli.

Datenvisualisierung und -analyse

Die SutterPatch Software wurde entwickelt, um die Navigation und Analyse komplexer Datensätze zu vereinfachen. Das Oszilloskop-Fenster unterstützt mehrere Ansichtsmodi sowohl in zweidimensionaler als auch in einer innovativen dreidimensionalen Darstellung. Die 3D-Ansicht ist besonders während der Assay-Entwicklung nützlich. SutterPatch baut auf der neuesten Version der bewährten Igor Pro-Plattform auf und kombiniert die native Igor Pro-Funktionalität mit einer Fülle von Funktionen, die auf elektrophysiologische Anwendungen zugeschnitten sind. Sowohl Neueinsteiger als auch erfahrene Anwender von Patch-Clamp-Programmen werden sich mit der SutterPatch-Software wohl fühlen.